La Institución Educativa Secundaria “SAN MARTÍN” de la ciudad de Juliaca, fue creada por RDZ. N° 0223, del 13 de Junio de 1990 como Colegio Nacional San Martín, ubicado al noreste de la ciudad de Juliaca, con dirección en el Jr. José Bernardo Alcedo s/n en la urbanización Tambopata, iniciando su funcionamiento con 41 estudiantes los mismos que fueron promocionados de la Escuela Primaria de Tambopata, institución que facilitó un ambiente prestado para así garantizar y dar comienzo con esta prestigiosa vida institucional.
Con la preocupación latente de directivos y padres de familia de esos años, se hace gestiones con la finalidad de contar con terreno propio, consiguiendo dicho propósito para alegría de toda la familia sanmartiniana; y en el año 1991 se construye las primeras aulas con material rústico con participación plena e incondicional de los padres de familia que entendían que la institución era la única del nivel de educación secundaria en la zona y que se merecía mejores ambientes para sus propios hijos y sean educados en mejores condiciones. En el año 1995 gracias las gestiones realizadas, INFES construye aulas, espacios administrativos y una batería de servicios higiénicos de material noble, a pesar de ello fue insuficiente ya que se tenía matriculados a 1518 estudiantes distribuidos en 42 secciones, por lo que la necesidad de más aulas siempre ha sido una necesidad de la institución.
Muchas características identifican a los docentes y padres de familia sanmartinianos, su amor a la institución, el afán de trabajo y colaboración, por ello tuvieron participación directa y plena en la construcción del patio de honor así como de aulas, entre las actividades más resaltantes, por ello el reconocimiento eterno de todas las generaciones y comunidad en general a toda esa iniciativa.
Gracias a las gestiones realizadas por los directivos en el año 2008 se concluye en el año 2016 con la construcción de seis aulas, una cancha sintética y la instalación de un cobertor solar, ejecutadas por la Municipalidad de San Román, todo ello al servicio de todo el estudiantado.
Desde los primeros años de vida institucional hasta la actualidad la IES. SAN MARTÍN, se ha caracterizado, por estar a la vanguardia de los concursos escolares ocupando los lugares de honor, en el año 2000 los estudiantes se proclamaron ganadores a nivel regional de la Feria de Ciencias y Tecnología (FENCYT) quedando en segundo lugar a nivel nacional. En el año 2001 también ganadores a nacional en el Concurso de Innovaciones Matemáticas “Resolviendo Problemas”, siendo reconocido ese mismo año como Colegio Excelencia a nivel de centros educativos estatales por la UGEL San Román.
El arte y el deporte son también pilares que demandan reconocimiento, formando parte de la historia del colegio ya que en los diferentes eventos, concursos y juegos escolares, cada año se ocupa los primeros lugares, llegando hasta instancias de etapa regional y macroregional; lo cual enorgullece a todos los estudiantes, docentes y padres de familia.
La IES. SAN MARTÍN, está llamada a cumplir un rol determinante con los estudiantes, y es, el de formarlos de manera integral, logrando que sean autónomos y competentes y así sumarse a la sociedad como entes importantes capaces de provocar cambios importantes en la sociedad.